Em algumas situações, principalmente falhas repetidas de implantação embrionária após FIV com embriões de boa qualidade, pode-se realizar injúria endometrial, ou seja, provocar pequenas lesões no endométrio para facilitar o processo de implantação do embrião. O processo de injúria endometrial é bastante simples e habitualmente feito no ciclo anterior ao tratamento. É utilizado um cateter de silicone, fino, macio e flexível. É um processo rápido (menos que um minuto) e indolor. Na maioria das vezes não ocorrem cólicas ou sangramentos, mas se houver serão de pequena intensidade.
Outra opção é a infusão de G-CSF (Fator Estimulante de Crescimento de Granulócitos) intra-útero, semelhante à uma inseminação intra-útero, mas utilizando-se dessa substância que provocará também alterações no endométrio semelhante à injúria. É simples, indolor e sem efeitos colaterais. É realizado no mesmo ciclo da estimulação ovariana. Também é indicado em casos de crescimento endometrial aquém do desejado, ou seja, endométrio fino.